一般来说，申请食品小作坊登记证的具体流程如下广东省人民政府：

1. 1.准备申请材料：申请人需先取得营业执照，并准备食品小作坊登记申请书、负责人身份证复印件、生产加工场所平面图、工艺流程图、生产设备设施清单、食品安全管理制度等材料。如果委托他人办理，还需提交授权委托书及代理人的身份证明文件。

2. 2.提交申请：申请人可通过网上办理或窗口办理的方式，向所在地县级市场监督管理部门提交申请材料。县级市场监督管理部门根据工作需要，可能会委托派出机构（市场监管所）负责其辖区内食品小作坊登记申请的受理工作。

3. 3.收件与受理：窗口工作人员对申请材料进行收件，核对申请人是否符合申请条件，材料是否齐全、符合法定形式。如果申请材料齐全、符合法定形式，或者申请人按照要求提交全部补正材料的，应当受理，并出具受理通知书；如果申请材料不齐全或不符合法定形式，将当场或在 5 个工作日内一次告知申请人需要补正的全部内容。

4. 4.审查：市场监督管理部门需要对申请材料的实质内容进行核实的，会指派两名以上工作人员对申请人生产加工场所进行现场核查。核查人员应自接受现场核查任务之日起 10 个工作日内，完成对生产加工场所的现场核查，并填写食品小作坊登记现场核查表，制作现场核查记录。

5. 5.决定：市场监督管理部门应自受理申请之日起 20 个工作日内作出是否准予登记的决定。因特殊原因需要延长期限的，经本行政机关负责人批准，可以延长 10 个工作日，并应当将延长期限的理由告知申请人。如果申请符合条件，准予行政许可，将颁发《食品生产加工小作坊登记证》；如果申请不符合条件，不准予行政许可，将颁发《不予行政许可决定书》。

6. 6.制证与送达：准予行政许可的，窗口工作人员将在 0.3 个工作日内制作《食品生产加工小作坊登记证》，并在 0.2 个工作日内送达申请人，送达方式包括窗口领取、代理人送达、委托送达、公告送达、邮寄送达等。